หน้าที่หลักของเครื่องแยกน้ำคือแยกน้ำออกจากก๊าซ ป้องกันไม่ให้น้ำเข้าสู่สภาพแวดล้อมที่ปราศจากเชื้อจนก่อให้เกิดมลพิษทุติยภูมิ และกำจัดไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ในอากาศที่ปราศจากเชื้อ
เครื่องแยกน้ำเป็นอุปกรณ์ลดความชื้นที่ใช้กลไกหรือวิธีการเพิ่มพลังงานจลน์เพื่อแยกน้ำอิสระออกจากการไหลของอากาศ เครื่องนี้มีการใช้งานที่หลากหลาย โดยเฉพาะในสภาพแวดล้อมที่จำเป็นต้องควบคุมความชื้น เช่น ในก๊าซที่ออกมาจากคอมเพรสเซอร์วงแหวนน้ำ การแยกน้ำและก๊าซสามารถป้องกันไม่ให้น้ำเข้าสู่สภาพแวดล้อมที่ปราศจากเชื้อจนก่อให้เกิดมลพิษทุติยภูมิ และในขณะเดียวกันก็กำจัดไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ในอากาศที่ปราศจากเชื้อออกไป เพื่อให้แน่ใจถึงความบริสุทธิ์และความปลอดภัยของสภาพแวดล้อม
นอกจากนี้ เครื่องแยกน้ำประเภทต่างๆ ยังมีการใช้งานเฉพาะ เช่น:
เครื่องแยกน้ำมันและน้ำส่วนใหญ่ใช้ในการบำบัดน้ำเสียทางอุตสาหกรรม กำจัดสิ่งสกปรกและความชื้นโดยใช้หลักการตกตะกอนโดยแรงโน้มถ่วง และเหมาะสำหรับการทำความสะอาดถังน้ำมันและอุปกรณ์จัดเก็บน้ำมัน และน้ำกระบวนการที่ฉีดเข้าในการสกัดน้ำมัน
เครื่องแยกน้ำดีและน้ำเสียใช้เครื่องวัดค่าการนำไฟฟ้าเพื่อตรวจจับน้ำควบแน่นแบบออนไลน์ และควบคุมการทำงานของเครื่องแยกตามปริมาณด่าง เกลือ หรือกรดในน้ำควบแน่น เพื่อแยกน้ำดีและน้ำเสียโดยอัตโนมัติ